Климат на территории района резко континентальный. Средняя температура января минус 20-22°С, июля плюс 17-18°С, среднегодовая температура минус 1-4°С, средняя температура наиболее холодной пятидневки минус 37°С. Отопительный сезон с температурами окружающего воздуха менее 8°С составляет 240-265 суток
Полезные ископаемые
Территория района в основном расположена на заболоченной низменности, поросшей смешанным лесом. Полезные ископаемые осадочного происхождения. Почвы подзолистые, болотные. Район обладает значительными запасами торфа. По материалам геологических служб в северной части района выявлено 14 месторождений торфа с прогнозными запасами 952,6 млн.тонн, при средней глубине залегания 2,33м. В основном это месторождения верхового и переходного типа. Экономическая оценка месторождений сапропеля и песков отсутствует.
Основное богатство района - лес, а также нефть, добычу которой ведут компании, имеющие местом юридической регистрации другие муниципальные образования Ханты-Мансийского автономного округа - Югра.
Земельные ресурсы
Площадь Кондинского района 54,64 тыс. кв. км. - это 1/10 площади территории автономного округа. Земельные угодья представлены в основном лесными площадями, болотами и водными объектами, на долю которых приходится 97,8% (в т.ч. болота - 46,2%) от всей площади района.
Площадь сельскохозяйственных угодий в районе составляет 8565 га, из них пашни 2748 га, остальные угодья - сенокосы и пастбища. Посевы многолетних трав занимают 1889 га или 69% пашни. В районе имеются земли, пригодные для сельскохозяйственного освоения, позволяющие увеличить посевные площади в два раза.
Водные ресурсы
Речная сеть территории района принадлежит к бассейну Карского моря. На территории района объектами рыболовного промысла являются более 2 тысяч рек и озёр, а главной водной артерией является река Конда. Река Конда пересекает район с северо-запада на восток, имеет множество притоков, основные её крупные притоки: Юконда, Большой Тап, Кума. Озёрность составляет до 5%. Особенностью водосбора Конды является его исключительная заболоченность. На всей территории района Конда является типично равнинной рекой с небольшим уклоном. В долине реки находятся озера-старицы - вытянутые, дуговидной и серповидной формы, наследующие древние русла рек. Они сохраняют связь с рекой через проток: крупное проточное приустьевое озеро-сор Кондинский сор и озера - туманы - Леушинский туман, Турсунский туман.
На территории района земли водного фонда составляют 441,5 тыс.га. Фонд рыбохозяйственных водоемов района составляет: 49778 наименований озёр, 1373 реки и протоки.
Лесные ресурсы
Район обладает значительными лесосырьевыми ресурсами. Общая площадь земель лесного фонда Кондинского района составляет 5124,8 тыс.га. Лесной государственный фонд на территории района находится в ведении трёх лесхозов, в состав которых входит 11 лесничеств, 8 урочищ.
Запас возможный для эксплуатации - 898667 тыс.м3. Расчётная лесосека, по данным Междуреченского, Кондинского и Урайского лесхозов, позволяет вырубать в год 2270 тыс. м3. Основные лесообразующие породы: Кондинский лесхоз - сосна 66% и берёза 19%, Урайский лесхоз - сосна 25% и берёза 68%, Междуреченский лесхоз - сосна 24%, ель 33% и берёза 32%. В целом сосновые насаждения отличаются низким бонитетом (V-Vб) и низкой продуктивностью. Удалённость лесосырьевых баз и отсутствие дорог круглогодового действия на большей площади территории района влияет на эксплуатацию лесных ресурсов, прилегающих к зоне железной дороги, приводит к дальнейшему увеличению расстояний вывозки древесины. Уже сейчас расстояние вывозки достигает до 100 км.
Биоресурсы
Ресурсный потенциал животного мира района достаточно разнообразен и представлен многими видами охотничьих животных и птиц. Из млекопитающих наиболее ценными в хозяйственном отношении являются лось, дикий северный олень, норка, рыжая лисица, ондатра, выдра и белка. Биологические запасы, состояние численности диких охотничьих животных и проводимый комплекс охранных мероприятий стабильно способствуют обогащению и увеличению размеров популяции диких копытных животных (лося), млекопитающих семейства куньих и боровой дичи.
Ихтиофауна района представлена следующими видами: щука, язь, плотва, ерш, окунь, стерлядь, налим, карась, пелядь.
По заготовке продукции дикоросов район ранее занимал первое место в округе. Доступными для эксплуатации продуцирующие площади составляют 431 тыс.га. По данным лесхозов, эксплуатационные запасы ресурсов дикоросов по ягоде - более 9 тыс. тонн, по грибам - более 3 тыс. тонн. Возможные среднегодовые объемы сбора кедровых орехов составляют 1,7 тыс. тонн. Средняя урожайность брусники 50-100 кг/га, клюквы 30-100 кг/га, ореха 40-90 кг/га.